Cell | 建立人类树突状细胞与辅助性T细胞相互作用数学模型

细胞膜-细胞膜化学键异常复杂，包含大量大分子与频率自营，国际上钻研多年，仍旧是管当中窥豹。来自德国科隆PSL数据分析大学的Vassili Soumelis团队于在Cell新闻周刊上刊借助于题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的篇文章，创建了实验者与论点相结合的数据分析原理，实验者上，在核糖躯程度样品了细胞膜所分泌的细胞膜因子与应激反应；论点上，创建了频率输入编码器之时有的联系和化学键关联。所写以生命树突螺旋状细胞膜（Dendritic cell，缩写DC）与正因如此T细胞膜（T Helper cell，缩写Th）之时有的化学键为数据分析并不一定，分析了36例DC特别的频率大分子和17种Th分泌的细胞膜因子，并依靠这些数据创建数学模M-，演算借助于56种已经被实验者得借助于结论的细胞膜具躯来说，与此同时，还据信借助于290种不太可能关联，并得借助于结论了IL-12p70可以通过IL-1频率自营抑止17M-正因如此T细胞膜（缩写Th17）。首先，所写采集了生命单核膜可能的DC（MoDCs）和外周血液CD11c+DC（bDCs）两类细胞膜，并诱因24每隔。所有别于的诱因频率主要包含三大类共计14种。第一种：内源频率大分子，之外干扰素beta（interferon β，缩写IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样受躯的丝氨酸，之外Toll4受躯的选择性脂多糖（ lipopolysaccharide，缩写LPS），Toll1/2受躯选择性PAM3CSK4，Dectin1选择性Curdlan，Toll2/Dectin1选择性 zymosan，Toll7/8受躯选择性R848，Toll3受躯选择性 poly(I：C) 和NLRP3上皮细胞小躯活化剂铝钾；第三种：细菌病毒，之外冷却灭活的Candida albicans （缩写HKCA），舍恩菌（Listeria monocytogenes，缩写HKLM），Staphylococcus aureus （缩写HKSA）， Streptococcus pneumoniae （缩写HKSP）和菌株（influenza virus，缩写flu）。接依然，所写通过流式细胞膜术等原理，样品了36种DC特别大分子的解读持续性，其当中，29种处于细胞膜表面，7种处于细胞膜分泌上清初之当中。结果显示，除了一些已知的DC细胞膜叛离之外，所写还有了一些原先见到：（1）zymosan诱因的MoDCs 解读上佳的CD54 和PVR；（2）菌株诱因的MoDCs可以抑止ICOSL；（3）LPS诱因的MoDCs 可以抑止上佳的CD30L和CD83。再依然，所写将这些诱因过的DC与T细胞膜研究生院6天，随后样品Th的增殖效率以及17种Th特别细胞膜因子的解读分泌持续性。有趣的是，所写将Th和DC的显出相互相比较，见到，这二者之时有并不存在具躯来说的关联，反之亦然，两种诱因物对DC造成的效果十分相似，但是，这两种诱因物所处理的DC与T细胞膜研究生院之后，造成的效果很可以大相迳庭。接着，所写有别于生物接收者学的原理，以上述实验者数据创数学模型M-。有用来说，所写综合DC编码器的36种频率大分子和Th编码器的17种物理现象大分子，将两两之时有的关联精简为“可借介导”和“持续性介导”两种，并且，还重新加入资料库和已刊借助于文献当中的接收者，创建了复杂的频率介导网路。例如，通过这一模M-，所写见到， IL-10的持续性介导大分子之外OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而可借介导大分子之外Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，给予DC多种不同的诱因频率，所写就可以推断借助于Th叛离细胞膜IL-10的解读分泌持续性。之前，所写利用这样模M-，试表据信并得借助于结论原先细胞膜具躯来说。通过创建的模M-，所写见到，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2共同分泌时，倾向于介导IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 共同借助于现时，则非常倾向于介导IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的解读程度都显着减低。这些结果说明，IL-12参加Th17的抑止分化成。为了进一步探讨IL-12抑止Th17的机制，所写有别于活躯抑止Th的模M-，见到，IL-12并不会直接抑止Th17，但是，同时重新加入IL-1和IL-12，Th17就抑止借助于来了。这是一篇实验者与论点相结合的等奖项。实验者结果与量度数学模型相互支持，相互指导工作，相辅相成。如下表表，实验者以外有别于了密切关联关连性两以外数据，一是何种诱因下DC细胞膜的叛离，二是叛离后的DC对T细胞膜的作用。论点以外以DC和T细胞膜的编码器细胞膜因子为两大，创建了细胞膜因子之时有的可借和持续性介导网路模M-。通过这一模M-，所写证明了一些原先细胞膜时有具躯来说，最后再用实验者得借助于结论这些关联究竟属实。这篇篇文章的举世闻名有两处，一是创建和实验者论点相结合数据分析的时是，二是篇文章当中提供的诸多细胞膜介导接收者以供数据分析参见。原始借助于处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.